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博客

使用遗传特征ID和QC小鼠肿瘤模型

2019-03-06

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了解如何利用由特异的基因变化而产生的基因图谱鉴定和鉴别鼠源肿瘤模型

模型准确定义的重要性

如何准确的定义和鉴定科学研究中使用的动物模型和细胞品系对于验证和重复实验结果有着非常重要的意义。错误的细胞系命名在基础研究和医药研发中所引发的负面影响已经得到了研发人员的共识,据估计,生物医学研究中18%-36%的细胞系存在错误命名或者交叉污染的现象。

对于人源细胞系以及人源异种移植模型(比如传统的基于人源肿瘤细胞系的异种移植模型和基于人源肿瘤的异种移植模型),追踪肿瘤的来源及基因信息相对而言简单明了。利用DNA串联重复短序列(STR)基因库信息能够通过检测核心的串联重复短序列在基因中的位置显示出不同细胞系的关联性,特异性地发现人源化细胞,并针对不同细胞系进行特异性的比对分析。

ATCC等数据库已经建立了人源细胞系特异性的STR序列信息库,可用于对冠科生物平台中产生的实验数据进行比对分析。

鉴定和鉴别鼠源肿瘤模型

对于鼠源细胞系以及新建立的肿瘤模型(比如基于细胞系的同源移植模型和基于肿瘤的同源移植模型),鉴定和鉴别这些模型就会有些棘手。因为鼠源肿瘤通常来源于实验小鼠培育而产生小鼠品系,因此缺乏可针对此来源的小鼠用于STR序列库分析或者HLA配型分析的稳定标记物。为了能够更准确地鉴定,追踪和鉴别冠科生物平台中已有的鼠源模型,冠科生物建立开发了基于单独肿瘤模型的特异基因图谱的分析方法。

鼠源肿瘤模型的鉴定

我们所采用的鉴别方法的原理是利用RNA序列分析技术在原始细胞系或者原代肿瘤中寻找不同肿瘤模型独特的基因特性(比如独特的基因融合),这些基因特性经过RT-PCR及测序验证后将被制作为不同模型的基因图谱。转基因小鼠肿瘤模型,或者鼠源细胞系以及基于这些细胞系的同源移植肿瘤模型都可通过与母代小鼠的基因图谱进行比对分析,验证不同模型中特异性的融合基因是否被保留,同时也可监控肿瘤传代过程中是否产生了新的基因变化。上述方法使我们能够持续性地对冠科生物平台中的所有肿瘤模型进行准确的鉴定和鉴别,保证现有肿瘤模型的高质量得以延续。

肿瘤免疫治疗模型的质量验证

鼠源肿瘤模型已在免疫治疗领域发挥着巨大的作用,同时新的同源移植模型也在不断地开发中。由于其在不同类型实验中的广泛应用,对模型中所使用的细胞系或者肿瘤进行常规化的分析对于保证其质量和鉴别显得尤为重要。利用成熟的实验室技术而开发的“基因图谱”使得我们对肿瘤模型来源的追溯变得可行。

Topics: Oncology

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