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临床前生物标记物发现:最受关注的20个问题

2020-03-16

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回顾我们最近的网络研讨会中关于临床前生物标记物发现的关键问题,由Mike Batey回答。

体外筛选的生物标记物鉴定

体外筛选中使用的细胞系——它们来源于细胞系还是患者,您是否与来源于患者的细胞相关?

通常使用的细胞系是癌症治疗试验中常见的细胞系,并且可从供应商处获得,如ATCC。我们也可以使用来自体外PDX模型中的细胞。PDX来源于患者组织并在小鼠中增殖,因此更接近临床情况。

我们最近还推出了一个类器官平台,可用于初始筛选,包括来源于PDX和直接来源于临床患者材料的类器官。这提供了从体外筛选到体内试验的桥梁。

如何从体外筛选中识别生物标记物特征,并转变为临床或I期或II期招募?

通常,临床前阶段发现的临床相关生物标记物特征可用于临床分析,并且根据是否存在经验证的生物标记物特征来选择和分层用于试验的患者。最终将以开发伴细胞诊断检测为目标,与靶向治疗一起用于临床。

体外阶段发现的生物标记物携带至体内/临床的可能性有多大?

临床前/临床方程的两侧通常没有很好地结合在一起。(我公司与我们的姐妹公司MBL之间的)生物标记物发现计划的主要目的之一是确保从临床前发现生物标记物到临床中使用的生物标记物之间实现无缝结合。

在生物标记物发现中使用转化PDX模型和小鼠临床试验

您认为单个PDX模型的数据有多大价值?

具有特定遗传特征的个体PDX模型可提供关于药物作用机制的很多信息。对于小鼠临床试验,使用了几种不同的PDX模型,这是整个聚类研究的结果,而不是具有最大价值的单个PDX的结果。

我们需要使用多少个PDX模型或细胞系才能获得有意义的结果?

这可能取决于许多因素,包括所提出的问题,然而,我们在过去使用30~40个细胞系和少至21个PDX模型进行了成功的研究。

MCT中每组小鼠的理想数量是多少?

不同研究中每组小鼠的理想数量不同,但通常每组使用2/3只小鼠。我们发表的MCT论文详细介绍了MCT的适当设计和使用。

PDX模型的广泛性是否足以将结果用于患者选择/分层?例如,AML的遗传异质性很高。在CrownBio的AML PDX模型中是否适当地体现了这一点?

这取决于疾病类型。对于几种癌症,如结直肠癌,我们有大量可用的模型。对于AML,我们只有有限数量的模型,这些模型可能无法完全反映患者的异质性。

您的MCT PDX模型来自何处?

来自CrownBio PDX库,可方便地在线检索,以审查可用的各种模型集合。

您的肿瘤体积分析人员是否对治疗设盲?您的体内模型的各组规模(把握度、效应量)?

我们确实能够在对治疗组设盲并独立于给药的情况下运行肿瘤模型。体内研究的各组规模根据所提出的问题、正在运行的模型的稳健性和所需的把握度而变化。对于典型的PDX,数量可以低至每组3只动物,通常为5~8只。

如何检测药物的耐药性?

通常情况下,PDX模型(或细胞系)将在相关给药方案中暴露于相关浓度的药物,并测量疗效。

克服生物标记物发现挑战的新策略

在临床环境中发现、开发、验证直至实施生物标记物是一个漫长而复杂的过程。有哪些新策略和应用可利用更多生物标记物驱动的临床试验?

我们的平台可以支持从模拟阶段到体外和体内阶段的药物发现和开发,并与我们的姐妹公司MBL合作,将发现的生物标记物直接用于临床。这是一个复杂的过程,但凭借内部专业知识,您可以在该过程的每个步骤都得到支持。

当您使用生物标记物进行临床评价时,最具挑战性的任务是什么?

将临床前生物标记物转化为临床领域面临众多挑战。为使这一过程尽可能顺利,关键在于牢记您想要如何在临床上使用您的生物标记物,并确保您在临床前领域中选择用于进一步开发的生物标记物具有临床相关性。

生物标记物发现中的操作问题

如果我们不想披露药物的鉴定和靶点,您还能进行生物标记物发现吗?

是的,我们可以,并且有几个例子表明我们过去曾为客户这样做过。

我们是否必须进行实验室工作,或者我们是否可以使用历史数据或其他供应商的数据?

我们很高兴从其他供应商获取原始数据,或使用历史数据进行生物标记物发现。

我们可以回顾性地查看临床数据来确定生物标记物吗?

是的,这是完全可能的。然后,我们还可以建议并进行适当的临床前研究,以验证该生物标记物可进一步用于临床。

生物信息学分析需要多长时间?

提供原始数据后约2周。

当您为客户发现生物标记物时,生物标记物的知识产权属于谁?

这取决于如何建立客户研究和合同,以及客户希望如何与我们合作。选项包括客户保留所有知识产权,或者在某些情况下,我们可以共享知识产权,这取决于客户希望如何与我们的团队合作。

如果我们使用CrownBio进行这些研究,是否必须在中国进行?

不,我们在北美和欧洲都有研究中心可以进行研究。有些模型在特定的地理区域运行,但我们可以建议最合适的地理区域。

在您的生物标记物发现过程中,您是否只关注宿主生物标记物?对微生物群有兴趣吗?

我们正在培养对微生物组的兴趣,以及如何评价其影响。

您是否尝试鉴定抗PD-1应答生物标记物?

是的,我们能够并且已经做到了这一点。

如有任何关于生物标记物发现能力的进一步问题,请与我们联系。

Topics: Blog, Oncology

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