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基于高通量测序的SNP方法对细胞系和模型进行鉴定

我们基于高通量测序的肿瘤细胞系和模型鉴定服务保证您研究的可重复性

您的细胞系和生物模型真的如您所想吗? 据多项研究表示,五分之一到三分之一的常见细胞系已被种内/种间细胞系、支原体和/或病毒污染。

通过使用我们基于高通量测序的细胞系和模型鉴定服务,保证您生物样品的准确性和高质量数据的重复性。本服务通过检测600多个SNPs位点和染色体片段来精确鉴定包括细胞系、类器官、异种移植模型和患者组织在内的各种小鼠和人类各种生物样本。我们还为最常用的约1200多种人源肿瘤和30多种鼠源同源细胞系模型建立了独特的DNA指纹图谱。

基于高通量测序的SNP方法对细胞系和模型进行鉴定

通过使用高通量测序的SNP方法, 您能实现三层模型认证.

客户反馈

“作为一家致力于高质量药物研发的机构,我们为我们的高质量的研究而感到自豪。为了确保我们达到这些标准,我们必须要适时验证我们的大型细胞库,因为它们是我们研究的基础。从前我们使用STR方法对细胞系进行鉴定,但发现这项技术缺乏检测小鼠细胞污染的敏感性和能力。与其他服务不同的是,CrownBio的细胞系鉴定服务提供了高水平检测的灵敏度和准确性,以及检测跨物种和其他污染的能力,助力我们继续我们的开创性研究。”

刘洪春教授,
中国科学院上海药物研究所

分析比较 基于高通量测序的SNP分析方法 STR分析方法 SNP分析方法
技术 条码深度高通量测序 多重PCR和毛细管电泳 多重PCR/qPCR
读出类型 数字(干净,接近零的量化误差) 类似物(噪声大,量化误差大) 类似物(噪声大,量化误差大)
人类样本验证 支持 支持 支持
小鼠样品验证 支持 限定 不支持
MMR缺陷细胞系鉴定 支持 不支持 支持
污染检测灵敏度 高 (1%) 低到中 (5-20%) 低到中 (3-20%)
精确度 低到中 低到中
通量
污染物鉴定 支持 不支持 不支持
量化污染率 支持 不支持 不支持
适用于大型生物库 支持 不支持 不支持
物种间污染物检测 支持 限定 限定
物种内污染物检测 支持 限定 限定
w/o 参考检测污染物 支持 不支持 不支持
估计3个以上细胞系的混合比例 支持 (1% 敏感性) 不支持 不支持

可用的附加服务:

  • 支原体污染检测
  • 病毒感染检测
  • 人体样本的性别和种族鉴定
  • 样本的遗传漂移和构建系统发育

可鉴定的人类和小鼠细胞系列表: https://qc.crownbio.com
NAR基因组学和生物信息学, 第2卷, 第三期, 2020年9月, lqaa060 https://doi.org/10.1093/nargab/lqaa060

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