您的细胞系和生物模型真的如您所想吗？ 据多项研究表示，五分之一到三分之一的常见细胞系已被种内/种间细胞系、支原体和/或病毒污染。
通过使用我们基于高通量测序的细胞系和模型鉴定服务，保证您生物样品的准确性和高质量数据的重复性。本服务通过检测600多个SNPs位点和染色体片段来精确鉴定包括细胞系、类器官、异种移植模型和患者组织在内的各种小鼠和人类各种生物样本。我们还为最常用的约1200多种人源肿瘤和30多种鼠源同源细胞系模型建立了独特的DNA指纹图谱。
通过使用高通量测序的SNP方法, 您能实现三层模型认证.
“作为一家致力于高质量药物研发的机构，我们为我们的高质量的研究而感到自豪。为了确保我们达到这些标准，我们必须要适时验证我们的大型细胞库，因为它们是我们研究的基础。从前我们使用STR方法对细胞系进行鉴定，但发现这项技术缺乏检测小鼠细胞污染的敏感性和能力。与其他服务不同的是，Crown Bioscience 的细胞系鉴定服务提供了高水平检测的灵敏度和准确性，以及检测跨物种和其他污染的能力，助力我们继续我们的开创性研究。”
刘洪春教授,
中国科学院上海药物研究所
| 分析比较 | 基于高通量测序的SNP分析方法 | STR分析方法 | SNP分析方法 |
|---|---|---|---|
| 技术 | 条码深度高通量测序 | 多重PCR和毛细管电泳 | 多重PCR/qPCR |
| 读出类型 | 数字(干净，接近零的量化误差) | 类似物（噪声大，量化误差大) | 类似物（噪声大，量化误差大) |
| 人类样本验证 | 支持 | 支持 | 支持 |
| 小鼠样品验证 | 支持 | 限定 | 不支持 |
| MMR缺陷细胞系鉴定 | 支持 | 不支持 | 支持 |
| 污染检测灵敏度 | 高 (1%) | 低到中 (5-20%) | 低到中 (3-20%) |
| 精确度 | 高 | 低到中 | 低到中 |
| 通量 | 高 | 低 | 低 |
| 污染物鉴定 | 支持 | 不支持 | 不支持 |
| 量化污染率 | 支持 | 不支持 | 不支持 |
| 适用于大型生物库 | 支持 | 不支持 | 不支持 |
| 物种间污染物检测 | 支持 | 限定 | 限定 |
| 物种内污染物检测 | 支持 | 限定 | 限定 |
| w/o 参考检测污染物 | 支持 | 不支持 | 不支持 |
| 估计3个以上细胞系的混合比例 | 支持 (1% 敏感性) | 不支持 | 不支持 |
可用的附加服务:
可鉴定的人类和小鼠细胞系列表： https://qc.crownbio.com
NAR基因组学和生物信息学, 第2卷, 第三期, 2020年9月, lqaa060 https://doi.org/10.1093/nargab/lqaa060
| 样本类型 | 数量 | 运送条件 | |
|---|---|---|---|
| DNA | 粉末 | 100-500ug | 室温(RT) |
| 液体 | 湿冰 | ||
| 细胞团块 | 至少100万个细胞 |
干冰 |
|
| 新鲜肿瘤组织 | 速冻 | 至少200mg或100万个细胞 | 干冰 |
| 福尔马林固定 | RT，在72小时之内运送 | ||
| FFPE组织 | 未染色的组织切片（以及H＆E染色的相邻切片） | RT | |
与STR相比，SNP的主要优势包括：
SNP尤其适用于以下细胞：
7-11个工作日
通过Y染色体上的3个SNP推断人类性别。请注意，Y染色体在某些癌症基因组中丢失，因此“女性”的预测结果可能并不总是准确的。
我们的组合检测可以对三个参照群体进行分类，汉族(CHB)、尼日利亚约鲁巴族(YRI)和具有北欧和西欧血统(CEU)的犹他州居民。当总SNP的70%以上支持一种群体时，就可以预测种族。
我们拥有32种最常用的同基因模型的参考谱图。当检测到80%以上的特征突变时，可以预测同基因模型。
大于90%的相似率被视为匹配。
告诉我们您的需求